Soutenance de thèse de Monsieur Kévin RAVENEL

Le 13 mai 2024 de 14:00 à 17:00

14h00 | Institut de Biologie en Santé | CHU d'Angers | Salle rez-de-chaussée | 4, rue Larrey | ANGERS

Sujet : Étude des mécanismes d’adaptation des espèces du genre Scedosporium aux environnements pollués et pathogénie

Directrice de thèse : Madame Sandrine GIRAUD

RÉSUMÉ

Les champignons du genre Scedosporium sont saprophytes et pathogènes opportunistes chez l’Homme. Ces champignons présentent un tropisme particulier pour les milieux anthropisés et pollués. Plusieurs études ont révélé leur capacité à dégrader les molécules polyaromatiques issues de polluants environnementaux. Des travaux antérieurs nous ont permis de mettre en évidence que les espèces du genre Scedosporium sont capables de croître en présence de lignine. Dans l’environnement, les étapes du catabolisme des molécules polyaromatiques convergent vers un nombre limité de molécules aromatiques simples (catéchol, protocatéchuate, hydroxyquinol et gentisate) qui sont prises en charge par les voies intermédiaires centrales, également désignées sous le nom de « Fission pathways ». Une analyse bio-informatique nous a permis de caractériser les clusters de gènes dégradant ces molécules centrales chez S. apiospermum et S. aurantiacum. Des résultats expérimentaux nous ont permis de démontrer la fonctionnalité du cluster de la voie du gentisate en présence de cette molécule. Les dioxygénases qui catalysent l’ouverture du cycle benzénique, étape clé du mécanisme catabolique, sont des cibles privilégiées pour la conception de souches de délétion. Pour ce faire, la technologie CRISPR-Cas9 a été adaptée et optimisée avec succès au sein de deux souches de S. apiospermum : une souche sauvage et une souche Δku70. Pour ce faire, des protocoles différents ont été définis selon la fonctionnalité du système de réparation NHEJ. Ainsi, des souches de délétion pour le gène codant la dioxygénase ont été générées pour chacune des voies. Ces délétions impactent différemment la croissance de ces souches sur des milieux en présence des molécules centrales correspondantes. Ces résultats suggèrent, dans certaines conditions, la mise en place de mécanismes de compensation qui restent à définir. Enfin ce travail a permis d’établir pour la première fois un lien entre la dégradation des molécules aromatiques et la pathogénie d’un champignon pathogène opportuniste de l’Homme dans des expériences in vitro.

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