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Soutenance de thèse de Monsieur Thomas CHARPENTIER
Le 8 février 2023 de 09:30 à 12:30
09h30 | Faculté des Sciences | AMPHI L004 | 2, boulevard Lavoisier | ANGERS
Sujet : Produits d’origine naturelle ciblant la voie « Unfolded Protein Responses » (UPR) : vers une protection alternative des cultures
Directeur de thèse : Monsieur Pascal RICHOMME
RÉSUMÉ
La découverte de nouvelles solutions antifongiques pour la protection des cultures est un enjeu majeur en raison de de l'émergence de résistances aux fongicides conventionnels et de leur l'impact écotoxicologique. De précédent travaux ont montré que la voie UPR (« Unfolded Protein Response ») était une cible prometteuse pour le développement de nouveaux fongicides. IRE1 est l’unique effecteur de cette voie chez les champignons, elle restaure l'homéostasie du réticulum en épissant l'ARNm hac1. Le développement d'un test de criblage sur Saccharomyces cerevisiae incluant un système rapporteur de l'activité d’IRE1, suivi du criblage de 77 produits naturels, a permis d'identifier 7 inhibiteurs potentiels et a mis en évidence la classe des xanthones polyhydroxylés et prénylés. L'inhibition de l'épissage de l'ARNm hac1 a ensuite été confirmée par RT-PCR, pour le composé le plus actif, la γ-mangostine. L'application de ces inhibiteurs à dose sublétale induit une réduction significative de l’aire des nécroses provoquées par Alternaria brassicicola et Botrytis cinerea. Ensuite, le test de criblage a été adapté au fractionnement bioguidé. L’étude d’un extrait de Clusiacées a conduit à identifier 4 xanthones actives. Parallèlement, pour mieux comprendre le RSA (relation structure activité) des composés actifs, une étude de modélisation moléculaire et d’(hémi)synthèse a été entreprise. Deux séries d'analogues ont été conçues, puis criblées in-silico. Les résultats du « docking » ont permis de sélectionner 24 composés. Dix d'entre eux ont été (hémi)synthétisés avec 16 autres et testés, dont cinq présentent une activité intéressante.