Soutenance de thèse de Madame Romane LAPOUS

Le 16 décembre 2025 de 14:00 à 17:00

14h00 | Faculté des Sciences | Bâtiment L | AMPHI L003 | 2, boulevard Lavoisier | ANGERS

Sujet : Vers la durabilité de la résistance génétique à la tavelure : apports des données –omiques pour la compréhension et la prédiction de la réponse du pommier face à Venturia inaequalis

Directeur de thèse : Monsieur Charles-Eric DUREL

RÉSUMÉ

Dans un contexte de production de pommes indissociable des fongicides, la sélection de variétés durablement résistantes à la tavelure, provoquée par Venturia inaequalis, constitue un enjeu majeur. Le pyramidage de résistances génétiques complémentaires représente une stratégie prometteuse pour limiter l’adaptation de ce champignon à haut pouvoir évolutif. Ce travail de thèse visait à préciser, dans une descendance, le mode d’action de quatre loci à caractère quantitatif de résistance (rQTL) à la tavelure se complémentant sans que leurs mécanismes ne soient élucidés. Par une approche non ciblée, nous avons étudié le métabolisme foliaire de cette descendance avant ou après inoculation par la tavelure afin d’identifier des loci impliqués dans la variation de métabolites (mQTL). L’analyse des mQTL co-localisant avec les rQTL a confirmé leurs fonctionnements distincts et révélé l’implication du QTL qT1 dans des changements métaboliques majeurs, dont l’induction des triterpènes. Une analyse ciblée sur cette voie a permis d’identifier quatre candidats dont le rôle dans la résistance à la tavelure reste à caractériser. En parallèle, le développement des génomes phasés parentaux de la descendance a révélé les variations entre allèles de chaque QTL, suggérant de nouveaux gènes candidats. Enfin, la spectroscopie a été évaluée en comparaison aux données génomiques pour prédire le métabolisme et la résistance à la tavelure de cette descendance. L’ensemble de ce projet a permis de développer les outils et les connaissances nécessaires à une meilleure compréhension des mécanismes impliqués dans la défense du pommier à la tavelure pour développer des variétés durablement résistantes.

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