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Séparés par des virgules

Visioconférence | Soutenance de thèse de Madame Caroline LACAULT

09h00 | INRAE | Bâtiment E | Salle Authion | 42, rue Georges Morel | BEAUCOUZE

Sujet : Epidémiologie et étiologie de la nervation blanche de la courgette causée par des bactéries du complexe d’espèces Pseudomonas syringae

Directeur de thèse : Madame Marie-Agnès JACQUES

RÉSUMÉ

La nervation blanche de la courgette (VCZ) affecte les plantules en pépinière et induit des nécroses, des éclaircissements des nervures, des retards et des blocages de croissance. Cette maladie transmise par les semences est causée par des bactéries du complexe d’espèces Pseudomonas syringae (Pssc). La fréquence des lots de semences contaminés croît depuis une 20aine d’années et peu de connaissances épidémiologiques sur la VCZ sont disponibles. L’objectif de cette thèse était de caractériser les souches VCZ et de comprendre comment elles contaminent les graines. Ainsi, 54 souches VCZ ont été caractérisées phylogénétiquement, génotypiquement et phénotypiquement. Des outils moléculaires de détection et d’identification ont été développés grâce aux analyses de génomique comparative et utilisés lors d’une enquête épidémiologique dans des parcelles de courgette porte-graines et dans les lots de semences. Les voies de transmission aux graines de 2 souches VCZ ont été étudiées. Les résultats montrent que les souches VCZ appartiennent à cinq lignées génétiques (Clusters A à E) du phylogroupe 2 du Pssc et possèdent des gammes d’hôtes étroite (Cluster A) ou large (Cluster B à E) au sein des Cucurbitacées en lien avec leurs répertoires d’effecteurs de type III. Un nouveau schéma de typage multilocus et une nouvelle q-PCR multiplex mettent en évidence la prédominance des souches du cluster A dans les lots de semences mais pas dans les parcelles en végétation. Les voies transmission florale et vasculaire sont empruntées par 2 souches VCZ des Clusters A et E. Ces données permettant une meilleure compréhension de la VCZ serviront de base à l’amélioration de la lutte contre cette maladie.

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