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Soutenance de thèse de M. Valérian MELINE

09h00 | Faculté des Sciences | AMPHI L006 | 2, boulevard Lavoisier | ANGERS

Sujet : Phénotypage de l'impact d'effecteurs de type 3 sur les tissus végétaux par imagerie de fluorescence de chlorophylle

Directeur de thèse : Monsieur Tristan BOUREAU

RÉSUMÉ

Le phénotypage de l’impact des effecteurs de type 3 (ET3s) sur les tissus végétaux se heurte souvent aux limites de sensibilité et de débit des appréciations visuelles d’experts. L’objectif de cette thèse était d’exploiter les potentialités de l’imagerie de fluorescence de chlorophylle pour le phénotypage de l’impact des ET3s de bactéries du genre Xanthomonas sur les tissus végétaux. Ainsi, l’amélioration du débit de phénotypage par une approche de segmentation automatisée des symptômes appliquée au phénotypage d’une collection de souche de Xanthomonas pathogènes sur haricot, a permis de s’intéresser à la corrélation entre le pouvoir pathogène et la composition des répertoires d’ET3s de ces souches. De plus, l’amélioration de la sensibilité du phénotypage a permis de caractériser l’impact de l’acquisition de gènes impliqués dans la sécrétion des ET3s sur les risques d’émergences de nouvelles bactéries phytopathogènes. Enfin le développement d’une méthode d’analyse d’image permettant la combinaison de l’information portée par différents paramètres de fluorescence de chlorophylle a permis de discriminer de manière pertinente l’impact d’ET3s sur les tissus végétaux dans des situations non différentiables par des appréciations visuelles. De tels résultats ouvrent des perspectives intéressantes pour la recherche de signatures spécifiques de l’impact d’ET3s sur les tissus végétaux.

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