L’offre de formation doctorale de L’UNAM s’articule autour de 9 Écoles doctorales thématiques - dont 8 concernent l’Université d’Angers - couvrant les domaines de recherche suivants :
- ED VENAM : Végétal, environnement, nutrition, agroalimentaire, mer
- ED SCE : Sociétés, cultures, échanges
- ED 3MPL : Matière, molécules, matériaux en Pays de la Loire
- ED DEGEST : Droit, économie, gestion, environnement, sociétés et territoires
- ED Biologie santé
- ED STIM : Sciences et technologies de l’information et de mathématiques
- ED CEI : Cognition, éducation, interactions
- ED Pierre Couvrat : Droit et science politique
La cohérence de l’offre de formation est renforcée par l’action des 3 Collèges doctoraux de sites (Collège doctoral d'Angers, Le Mans, Nantes) réunissant les représentants de chaque École doctorale et des établissements impliqués localement.